PCR multiplex para Streptococcus neumoniae

Tema: Diagnóstico rápido y preciso a través de PCR multiplex para detectar Streptococcus neumoniae.

Objetivo: Utilizar métodos moleculares para la mejora del diagnóstico etiológico del Streptococcus neumoniae.

Materiales: muestras de LCR de 125 pacientes para el estudio.

El antígeno se detectó usando un kit de prueba de aglutinación de látex comercial. 

Procedimiento: Toma de muestra LCR por punción, PCR multiplex se seleccionaron los siguientes genes: capsulación ( bexA) en H. influenzae; se realizó usando cebadores. La prueba exacta de Fischer se usó para encontrar la asociación entre la presencia de la enfermedad y los parámetros clínicos / bioquímicos, considerando dos colas p <0,05 como estadísticamente significativas. Sensibilidad, especificidad, valores predictivos positivos y negativos se calcularon utilizando el software Graphpad QuicCalc.

Las tasas de detección fueron más altas en la PCR múltiple para los dos organismos Streptococcus pneumoniae y Haemophilus influenzae tipo b.

Conclusión: La PCR multiplex fue más sensible que la detección de cultivo o antígeno, y el empleo de este ensayo puede aumentar significativamente la velocidad y la precisión de la identificación del patógeno.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29207725

Pruebas de Tamizaje

Permiten detectar una enfermedad de manera rápida aunque no es un diagnóstico definitivo.Entre estas tenemos el historial clínico del paciente, la auscultación de crepitaciones o ruidos respiratorios anormales, síntomas y signos como dificultad respiratoria. La principal prueba de tamizaje para detectar la neumonía es la radiografía de tórax.

Pruebas Confirmatorias

Permiten llegar a un diagnóstico definitivo de la enfermedad.

Hemocultivos: para identificar los agentes bacterianos que se asocian con la neumonía (Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, y Klebsiella pneumoniae). Se puede hacer una tinción de Gram y cultivo de esputo para buscar estas bacterias o virus que están causando los síntomas.

Tomografía computarizada del tórax método imagenológico que utiliza rayos X para crear imágenes trasversales del tórax y la porción superior del abdomen.

Gasometría arterial para identificar si hay una suficiente cantidad de oxígeno en sangre en los pulmones.

Conteo sanguíneo completo para verificar el conteo de glóbulos blancos.

Broncoscopia permite analizar a través de una sonda el estado actual de los pulmones.

https://medlineplus.gov/spanish/ency/article/000145.htm

http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S2304-51322016000200009&script=sci_arttext

http://scielo.sld.cu/scielo.php?pid=S0034-75312016000300006&script=sci_arttext&tlng=pt

Alteraciones en la Epigenómica

A pesar de los avances de la medicina moderna, la neumonía, tanto su morbilidad como su mortalidad permanecen en porcentajes altos. La respuesta ante un agravio infeccioso es estrictamente individual al estar influida por la estructura genética del huésped.

Los polimorfismos genéticos son capaces de modificar el riesgo de padecer determinado evento o suceso en una enfermedad específica por lo cual su reconocimiento permite personalizar la interacción entre ambiente y huésped. Un ejemplo de esto son los SNP localizados en las posiciones 223, 230 y 239 de los codones 52 (rs5030737; variante D), 54 (rs1800450, variante B) y 57 (rs1800451; variante C), respectivamente, que modifican la estructura molecular de la lectina de unión a la manosa, alteran su polimerización y determinan una deficiencia en su función, que es unirse a estructuras repetidas de azúcares presentes en una amplia variedad de bacterias y microorganismos promoviendo su eliminación mediante la activación del complemento. 
Otros polimorfismos que afectan en neumonía son Fox3 y FER.

http://www.medintensiva.org/es/neumonia-adquirida-comunidad-variantes-genicas/articulo/S0210569113001836/

https://acceda.ulpgc.es/handle/10553/18427

Alteraciones en la traducción 

El streptococcus pneumoniae sintetiza una capsula alrededor de el para contrarrestar o impedir la acción de diferentes antimicrobianos y esto representa una de las causas mas importantes para la persistencia de Neumonía. Los genes que codifican para la síntesis de la cápsula se encuentran organizados en un operón que contiene los genes wzd y wze, conservados en casi todos los serotipos conocidos, los cuales permiten la traducción de dos proteínas Wzd y Wze.

 

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0210569113001836